Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms