Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBDO15205 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBDO15205 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBDO15205 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBDO15205 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBDO15205 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBDO15205 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBDO15205 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms