Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TO15178 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms