Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms