Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms