Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms