Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms