Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PCH4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PCH4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PCH4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PCH4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PCH4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PCH4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms