Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E9PBE3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E9PBE3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.6 ms