Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A8MVJ9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.4 ms