Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms