Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms