Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF330Q9Y3S2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms