Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KCNIP3Q9Y2W7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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