Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms