Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTF2Q9UNY4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms