Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED23Q9ULK4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms