Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms