Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms