Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms