Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms