Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms