Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA6Q9UF33 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA6Q9UF33 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms