Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL42Q9P2K6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms