Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLAIN2Q9P270 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAIN2Q9P270 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms