Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms