Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms