Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms