Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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