Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms