Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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