Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR4Q9NPB9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms