Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms