Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASXL3Q9C0F0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASXL3Q9C0F0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms