Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms