Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms