Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms