Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms