Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms