Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms