Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms