Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD5Q99666 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms