Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF6Q99612 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms