Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms