Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms