Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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