Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMNQ96JQ2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMNQ96JQ2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLMNQ96JQ2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLMNQ96JQ2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMNQ96JQ2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms