Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C18orf8Q96DM3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms