Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms