Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.9 ms